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風險一：認定過程弄虛作假，被取消資格須補繳稅款
對在高新技術企業(yè)申請認定過程中存在嚴重弄虛作假行為的，由認定機構取消其高新技術企業(yè)資格并通知稅務機關按稅收征管法及相關規(guī)定，追繳其自發(fā)生行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠。需要注意的是，這里的追繳期限是自弄虛作假行為發(fā)生之日起，而一般情況下，高新技術企業(yè)在通過認定當年就開始享受優(yōu)惠，也就是說，相關企業(yè)因弄虛作假被取消高新技術企業(yè)資格，其在資格有效期內享受的相應稅收優(yōu)惠都要被追繳，這可能是一個不小的數(shù)字。
對此，相關企業(yè)一定要切實增強自身的科技創(chuàng)新能力，嚴格對照《高新技術企業(yè)認定管理辦法》（以下簡稱《認定辦法》）《高新技術企業(yè)認定管理工作指引》等政策的規(guī)定，準確判斷自身在知識產(chǎn)權、研發(fā)費用支出、高新技術產(chǎn)品（服務）收入、創(chuàng)新能力等方面是否達標，并據(jù)實進行高新技術企業(yè)資格申請，千萬不要帶著僥幸心理弄虛作假。
風險二：將境外所得錯誤適用優(yōu)惠稅率
《財政部 國家稅務總局關于高新技術企業(yè)境外所得適用稅率及稅收抵免問題的通知》（財稅〔2011〕47號）規(guī)定，以境內、境外全部生產(chǎn)經(jīng)營活動有關的研究開發(fā)費用總額、總收入、銷售收入總額、高新技術產(chǎn)品（服務）收入等指標申請并經(jīng)認定的高新技術企業(yè)，其來源于境外的所得可以享受高新技術企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。
實踐中，有的企業(yè)忽略了該政策適用的前提條件，其在進行高新技術企業(yè)資格申請時，僅以境內的研發(fā)費用總額、銷售收入總額、高新技術產(chǎn)品（服務）收入等指標進行申請，不包括境外的相關數(shù)據(jù)。但在獲得高新技術企業(yè)資格后，其卻將境外所得適用15%優(yōu)惠稅率，導致涉稅風險。對此，相關企業(yè)應當深入掌握該政策適用的條件，切忌斷章取義、盲目地將境外所得納入享受優(yōu)惠的范圍。
風險三：未按規(guī)定留存?zhèn)洳橘Y料
根據(jù)政策規(guī)定，高新技術企業(yè)在享受優(yōu)惠過程中，未按稅務機關要求提供留存?zhèn)洳橘Y料，或者提供的留存?zhèn)洳橘Y料與實際生產(chǎn)經(jīng)營情況、財務核算情況、相關技術領域、資格證書等不符，無法證實其符合高新技術企業(yè)優(yōu)惠政策條件的，稅務機關將按照稅收征管法、《認定辦法》等相關規(guī)定追繳稅款。
對此，相關企業(yè)在日常管理中，一定要注重做細做實材料整理及保管等工作，通過真實、詳細的資料證實自身符合享受優(yōu)惠的條件。比如，對研發(fā)人員的工時情況等進行詳細記錄，更好地證明研發(fā)費用歸集的合理性；將科技人員的勞動合同、考勤表、工資明細表、個稅申報表等相關數(shù)據(jù)進行核對檢查，并留存保管，以更好地證明科技人員占比符合條件規(guī)定。
風險四：因其他原因被取消高新技術企業(yè)資格而補稅
根據(jù)規(guī)定，對發(fā)生重大安全、重大質量事故或有嚴重環(huán)境違法行為（依據(jù)有關部門根據(jù)相關法律法規(guī)出具的意見判定）的，發(fā)生更名或與認定條件有關的重大變化（如分立、合并、重組以及經(jīng)營業(yè)務發(fā)生變化等）但未在三個月內向認定機構報告，或累計兩年未填報年度發(fā)展情況報表（企業(yè)獲得高新技術企業(yè)資格后，應在每年5月底前填報上一年度的發(fā)展情況）的高新技術企業(yè)，由認定機構取消其高新技術企業(yè)資格，并通知稅務機關按稅收征管法及有關規(guī)定，追繳其自發(fā)生上述行為之日所屬年度起已享受的高新技術企業(yè)稅收優(yōu)惠。
例如，B企業(yè)取得的高新技術企業(yè)證書上注明的發(fā)證時間為2019年11月25日，2020年5月10日，B企業(yè)發(fā)生重大安全生產(chǎn)事故，認定機構在2021年6月20日取消其高新技術企業(yè)資格。在資格取消前，企業(yè)一直自主申報享受高新技術企業(yè)所得稅優(yōu)惠。稅務機關接到認定機構的通知后，應當按照規(guī)定追繳B企業(yè)2020年度和2021年季度預繳已享受的稅收優(yōu)惠。
對此，相關企業(yè)一定要珍視高新身份，在日常生產(chǎn)經(jīng)營中切實增強風險防控意識，保障生產(chǎn)安全和產(chǎn)品質量，主動履行環(huán)保等社會責任。當發(fā)生分立、合并、重組等重大變化時，應及時向認定機構報告，同時要按規(guī)定及時填報年度發(fā)展情況報表。
轉載自“中國稅務報”，選入有刪節(jié)
